Verstoringen in de microbiota worden in verband gebracht met chronische ontstekingsziekten en er zijn verbanden vastgesteld tussen onevenwichtigheden in de microbiota en psychiatrische stoornissen zoals autisme, depressie en eetstoornissen.
Effectieve micro-organismen zijn kleine levende organismen die onzichtbaar zijn voor het blote oog en waarvoor een microscoop nodig is om ze te kunnen waarnemen.